第一，稀缺性假设。由于稀缺性假设是一切经济学的基本假设，新制度经济学也不例外。
第二，新经济人假设。一是新经济人和经济人一样追求个人利益最大化，但新经济人的个人利益呈现多样化，经济利益并不是新经济人唯一选择;二是新经济人是有限理性的。这是因为人自身理性能力的限制，导致个人在接受、储存、检索、传递和处理信息能力的水平和储量上受到的限制;三是新经济人更是机会主义者，这是因为他在追求效用最大化过程中，行为受到多方面的约束;这些约束主要来自人类自身认识能力的有限性，环境的不确定性和复杂性，信息的不完全性和不对称性，以及法律、规章、价值信念、伦理规范、道德观念、风俗习惯和意识形态等等，它们使人的行为成本得以改变，造成机会主义选择。
第三，不完全竞争市场假设。相对完全竞争，不完全竞争是客观存在的。不确定性、小数目谈判条件、资产的专用性、可交易数量的有限及交易地理位置的局限是导致市场垄断或不完全竞争的不同因素。
相对于新古典经济学，新制度经济学还有信息不完全、不对称假设，交易费用大于零假设，不确定性和复杂性假设，外部效应普通存在假设等。
2、假设下的企业理论。
新制度经济学认为，企业是将资源组织起来，有效地从事某种经营活动的载体，是一个资源配置的场所;同时，企业是一系列契约的组合，企业的形成是用“一个契约代替一系列契约”。科斯认为企业和市场是资源配置的两种可以互相替代的手段。在市场上，资源配置由非人格化的价格来调节，也就是说，产品流量与资金流量依靠亚当•斯密所谓的“看不见的手”来协调。在企业内，资源配置则通过权威关系来完成，也就是说，依靠企业内部行政力量这只“看得见的手”来配置企业内部的资源。此时，企业家的作用可使企业内部的组织管理成本低于市场交易成本，市场交易中众多的短期契约为企业内的数量较少的长期契约所取代;因而，企业的根本特征在于它是作为价格机制的替代物出现的。
3、企业理论下的新财务理论
3.1新财务理论的假设。在新制度经济学支持下，财务理论的假设也应该是：第一，稀缺性假设。资源的有限性和需求的无限性是企业一对永恒矛盾，企业就是从这一对永恒矛盾中寻找资源的利用效率提升和需求的平衡。财务管理的许多行为，诸如：利润管理、融资管理、投资管理、预算管理、税收筹划、利益相关者责任审计的产生等，都不是企业臆想的，而是解决一对基本矛盾的必然行为。第二，有限理性假设。有限性是客观存在的，市场经济的不成熟，制度的缺陷和有限理性的结合，更加降低企业资源配置效率和风险产生，此时，控制和协同是承受和解决有限理性的有效手段，因此，财务治理、母子公司、财务控制，企业风险控制运用而生。第三，市场相对有效假设。无论是要素市场，还是宏观政策市场，在社会主义市场经济的今天，随着利益主体地位逐步独立，市场总是有效的，也是相对的。同时，由于中国特色的社会主义，让权力成为资源配置的主角，也会造成市场是无效的，当然也是相对的，市场的相对有效性增加企业不确定性和风险，导致资源配置异化，财务管理活动随之变化。
3.2新财务理论的一般模型。新财务理论必须建立规范的一般模型。先让我们展开逻辑分析：
第一，企业资源配置过程的二重性。企业配置的资源不仅指自然资源，而且指“各种自然因素及其他成分组成的各种经济自然环境以及人类社会形成并不断增长的人口、劳动力、知识、技术、文化、管理等，凡是能进一步有利于经济生产和使用价值提高的都是资源。(宗寒，1994)”。由于资源本身固有的特性，导致“企业是物质性资源和非物质性资源的复合体(迟克莲，2000);由此可见，企业资源配置过程分为物质过程和非物质过程。对于企业资源配置的物质过程，其表现为采购交易、生产交易、销售交易和研发交易等四大交易循环;所以,我们可以把企业资源配置的物质过程称之为经营活动。对于企业资源配置的非物质过程,其表现为现金,信息;也就是说,现金和信息记录资源配置过程;当然，还有约束现金和信息的、让人理解又看不见的东西。我们可以把企业资源配置的非物质过程称之为财务活动。
第二，财务是现金的函数。在财务活动，财务显然是现金的函数，这也是主流财务理论核心思想。其实,现金是一个非常特殊的资源，其特殊性来自于现金的职能，即交换媒介、价值标准、价值储藏、延期支付或未来支付标准等。我们从现金的特殊性理解这对函数关系。
二、现金又是资源计量工具之一，即在资源体系中，现金作为资源的同时，还要承担计量或模拟计量各类资源，以便计算资源量的大小。三、现金运动的确反映了投资者行为、债权人行为、经营者行为、员工行为、政府行为等，但仅是浅表层的反映，伴随现金运动形成的权力、责任、利益关系无法用现金本身解释，必须另辟溪径。
第三，财务是信息的函数。在财务活动中，信息无时不在表达与现金有关或无关的内容，其也应该是财务的内容。所谓信息是指经过加工处理后对用户有意义的或者有用的数据，而数据是用来表示组织中所发生的事件或周围物理环境的原始事实统一，其具有可利用性、价值性、共享性、历史积累性、时效性和多次再生性特征。其实,信息也是一个非常特殊的资源，我们也从特殊性理解财务和信息的函数关系。一、信息本身就是最重要资源之一，见图2就可以看出。二，信息也是资源计量的工具之一，物质资源可以用现金计量，非物质资源中可计量部分，有的用现金模拟计量，有的用信息计量;非物质资源中不可计量部分只能用信息计量。虽然现金和信息都是资源计量工具之一，但信息对资源的计量更为广泛。三、信息还反映经营活动关系，尤其是会计信息。(薛云奎，2005)
其实，会计信息的存在不仅仅是为了向在两权分离条件下的所有者报告信息，更为重要的是会计信息本身作为管理信息重要的组成部分，是一切经济活动的主体所必需的。视野咨询(官网www.shcc-horizon.com)认为以资产负债表为历史和逻辑起点的会计信息体系，既能使会计信息按照其内在的规律得以延伸，又能与其他各类信息有机衔接，形成一个完整的企业信息体系。这个体系不仅使会计信息体系更加完整，并能满足决策的需要，而且能够使企业信息体系全面整合。由此可以看出，会计活动是财务活动的重要组成部分且以会计信息为延伸的企业信息整合都要纳入财务管理范围。但是，信息也仅仅是反映浅表层的经营活动关系，其中深刻的权力、责任、利益关系也无法体现。
第四，财务也应该是契约的函数。在分析财务作为现金、信息函数的时候，我们看到现金、信息既是资源，也是资源计量工具，其反映现金和信息背后的关系并不充分、清晰，充其量是计量的延伸。如何清晰地理解现金和信息背后的权力、责任、利益关系，应该引入契约概念。
契约是两个或两个以上的当事人之间，在自由平等、意志自立的前提下，为改进各自经济状况或经济预期所达成的，关于经济权利流转的协议或约定，其原则是平等、自由、互利、诚信(雷光勇，2004)。从新制度经济学的企业理论来看，交易成本理论着眼于企业与市场的关系;代理理论着眼于企业内部组织结构及企业成员之间的代理关系。这两种理论的共同点都是强调企业的契约性、契约的不完备性及由此导致所有权的重要性(张维迎，1999)。依据现代企业代理理论，企业的契约的主要可分为信贷契约、补偿契约和其他契约三类。信贷契约是指企业所有者、管理者与银行及债券持有者之间的合同;补偿契约是指管理者与所有者之间，以及管理者与员工之间的合同。其他契约包括管理者与第三方的合同，如合伙人、供应商、消费者等。
企业的契约解释了现金背后的关系。现金的运动是由一组契约做保证的，这组契约约束权利流转关系，约束各利益主体对企业资源的“掠夺”，促进契约各方合理预期的实现。具体表现在：一、企业是一个开放式的现金契约组合，组合中成员就是向企业提供各种资源的利益相关者。利益相关者之所以愿意给企业提供有形的和无形的资源支持，是因为他们相信通过企业的有效运作，能够产生合作盈余，即实现组合价值大于其所有成员独立行动的收益之和。二、现金契约把各个分散的子系统集合成一个整体，通过协调各个环节的量度，使各个子系统合理地组合起来对企业总体目标发挥作用，并形成财务控制系统的有机整体。三、现金契约与客观世界的其他系统一样具有自组织功能，它在明确各利益主体权力和责任的基础上，均衡利益相关者的经济利益，最大限度地减少或化解彼此间的利益冲突，使各个利益主体以总体目标为轴心联结成为一个有机的整体，加强彼此间的协调和融洽，增加凝聚力，减少离散性，使他们在各自相对稳定的位置上积极发挥作用。